生物潔凈室是在工業空調潔凈室的基礎上發展起來的，所以其標準也往往以工業潔凈室標準為基礎。通常的辦法是在參照工業潔凈室對空氣中懸浮粒子的允許濃度制定潔凈室級別的同時，再規定空氣中允許的微生物濃度。現有標準中所允許細菌濃度，包括浮游菌濃度和沉降菌濃度兩種。
國際上第一個有關微生物凈化級別的標準是美國航空和骯天管理局(NASA)制定的(潔凈室和潔凈工作臺微生物控制標準)，至今仍被廣泛應用于各國的相關標準和相關行業。其潔凈室級別可參照表44-7。
由于該標準是針對宇航工業，因而偏嚴。隨著生物潔凈室應用日益廣泛，各國又陸續制定出許多針對不同應用場合的標準。例如在藥品生產領域非常著名的GMP標準等。
所謂GMP(Good Manufacturing Practice)是藥品生產質量管理規范的簡稱。自美國1962年率先頒布了GMP后，各國相繼頒布實施GMP制度。1982年，由我國制藥工業部門首先頒布GMP，通過實施，經多次修訂于1999年由國家藥品監督管理局正式發布了我國現行的GMP標準。必須指出:雖然作為質量管理規范的GMP標準，并不僅僅是針對空氣潔凈技術和等級的標準，但空氣潔凈技術是GMP實施的一個必要條件。
