利用清潔的自來水以較大的水流速度（不小于1.5/s）對與冷卻水接觸的所有設備和管道進行5h~8h的循環沖洗，借助水流的沖擊力和洗刷力來清除設備和管道中的泥砂、松散沉積物和各種碎屑雜物，并通過主管道的最低點或排污口排放掉清洗水，同時拆洗Y型水過濾器。

由于熱交換器內的換熱銅管管徑較小，為避免系統清洗出來的污泥雜物堵塞換熱管，清洗水應從熱交換器的旁路管通過。熱交換器的清洗則采用拆下端蓋，單獨用刷子和水對每根換熱管進行清洗的方法。

物理清洗的優點是：可以省去化學清洗所需的藥劑費用；避免化學清洗后清洗廢液的處理或排放問題；不易引起被清洗的設備和管道腐蝕。存在的缺點是：部分物理清洗方法需要在中央空調系統停止運行后才能進行；清洗操作比較費工；有些方法容易造成設備和管道內表面損傷等。