微波解凍與高頻解凍原理一樣，是靠物質本身的電性質來發熱，利用電磁波對凍品中的高分子和低分子極性基團起作用，使其發生高速振蕩，同時分子間發生劇烈摩擦，由此產生熱量。國家標準規定，工業上用較小頻率的微波，只有2450MHz和915MHz兩個波帶。

微波加熱頻率越高，產生的熱量就越大，解凍也就越迅速。但是，微波對食品的穿透深度較小。微波發生器在2450MHz時，最大的輸出功率只有6kW,并且其熱能轉化率較低，約為50%~55%。在915MHz時，轉化率可提高到85%，可實現30~60kW的輸出功率。微波加熱解凍裝置見圖23-19。