當冷藏集裝箱用于運輸果蔬等易腐食品時，由于果蔬的呼吸作用而產(chǎn)生有害的氣體，氣體的數(shù)量和類型視果蔬品種而定。這些氣體若不排出，會導致生理紊亂或加快腐壞（氣調(diào)冷藏箱除外）。為保證箱內(nèi)空氣質(zhì)量，冷藏集裝箱一般都裝有新鮮空氣換氣風門格柵裝置，換氣的主要作用是排出冷藏集裝箱中貨物呼吸作用產(chǎn)生的有害氣體。

排氣的過程是將冷藏集裝箱內(nèi)貨物區(qū)的一定量空氣排到外部，并從冷藏集裝箱外吸入等量空氣。換氣的工作原理是利用冷藏集裝箱制冷裝置蒸發(fā)器風機所產(chǎn)生的風機前后壓差，進行自動換氣，即從位于風機吸入端的低壓部位吸入外界新鮮空氣，而從壓力側(cè)排出箱內(nèi)空氣。需交換的空氣量由經(jīng)校準的換氣風門格柵的打開程度而定。換氣風門不應在冷藏溫度-12℃以下的狀況下使用，否則進入的空氣中帶有濕氣，則可能會導致結(jié)冰，尤其影響與空氣輸送出口直接相鄰的產(chǎn)品，冰塊會損傷貨物并有可能中斷空氣流動。

冷藏集裝箱的換氣量可以根據(jù)需要進行調(diào)節(jié)，不同類型冷藏集裝箱的新鮮空氣交換設置均有明文規(guī)定的指導方法。新鮮空氣交換量取決于所運輸產(chǎn)品狀況以及儲存溫度，在一定程度上，還取決于包裝種類和冷藏集裝箱內(nèi)的堆裝方式，新鮮空氣交換的數(shù)量是以立方米/時表示，通常40英尺的冷藏集裝箱換氣風門的換氣量，可在0~300立方米/時之間，根據(jù)需要進行調(diào)節(jié)。由于換氣會增加冷藏集裝箱的熱負荷，因此在保證貨物運送質(zhì)量的前提下，應盡量減小換氣風門開度，減少換氣量。按照國際慣例，一般換氣量由貨物托運人來決定。